X-Men #001-003
Publicación: 1991
Guion: Chris Claremont
Arte: Jim Lee

Luego de que los X-Men se reúnen, Magneto vuelve al Asteroide M, pero es interrumpido por unos mutantes liderados por Fabian Cortez, que roban una nave espacial, se autoproclaman sus acólitos y lo ven como el salvador de la raza mutante. Juntos dirigen un ataque a Genosha, lo que eventualmente lleva a una confrontación con nuestros heroes, quienes para detenerlos idean un plan donde finalmente se enfrentarían a Magneto y sus acólitos en el mismo Asteroide M. El asteroide termina quemándose al entrar en la atmósfera y precipitarse a tierra, con Magneto y sus acólitos dados por muertos.

Uncanny X-Men #281 en adelante
Publicación: 1991
Guion: John Byrne
Arte: Whilce Portacio

Un mutante llamado Trevor Fitzroy aparece enviando una avanzada de Centinels con la misión de matar a Donald Pierce y a los Reavers, quienes se encuentran en Australia en la antigua base de los X-Men. Donald Pierce logra teletransportarse hasta Emma Frost en EEUU donde es seguido por los Centinels. Fitzroy es parte de un grupo secreto llamado los Upstarts, quienes buscan obtener poder a partir de diversos asesinatos de mutantes importantes, por los cuales se les otorga determinado puntaje. Otros miembros de este grupo serian Shinobi Shaw, el senador Graydon Creed, la terrorista Siena Blaze y el mutante Fabian Cortez, quienes serían evaluados por un mutante omnípata llamado Gamesmaster.
Finaalmente, Los Reavers quedan masacrados, Donald Pierce aparentemente muere, los estudiantes de Emma Frost, los Hellions, son asesinados por los Centinels, y la misma Emma queda en coma y es cuidada por los X-Men.

X-Factor #071 en adelante
Publicación: 1991
Guion: Peter David
Arte: Larry Stroman

Luego de que los integrantes originales se volvieran a unir a los X-Men, X-Factor comienza a ser un grupo financiado por el gobierno, para responder a problemas mutantes. Dirigidos por Havok y con Valerie Cooper como enlace con el gubernamental, el equipo estaría conformado, ademas, por Lorna Dane – Polaris-, la mujer loba Wolfsbane, Strong Guy, Multiple Man y Quicksilver.

New Mutants #098-100, X-Force #001 en adelante
Publicación: 1991
Guion: Rob Liefeld, Fabian Nicieza
Arte: Rob Liefeld

Los antiguos estudiantes conocidos como New Mutants deciden independizarse de los X-Men y se vuelven un grupo agresivo y paramilitar liderado por Cable. Principalmente combatirían, entre otros, al frente de liberación mutante dirigido por Stryfe. Sus miembros son: Cable, Domino, una mercenaria con el poder de cambiar las cosas a su favor, Cannonball, Warpath el apache con fuerza superhumana, Boom Boom, Feral, y un fugitivo de las arenas de mundo Mojo llamado Shatterstar, experto en el uso de espadas y acrobacias. Posteriormente se unirían Rictor con el poder de enviar ondas sismicas y Syrin, hija del mutante Banshee.
Con posterioridad, se descubre que Stryfe sin su casco es idéntico a Cable, y que Cannonball es un X-ternal, una casta de mutantes que son biológicamente inmortales, al sobrevivir a un ataque de Sauron que debió matarlo. Otros X-ternals serian Gideon, Krulle, e incluso Apocalypse.

X-Men #004-007
Publicación: 1991
Guion: John Byrne
Arte: Jim Lee

Los X-Men se enfrentan por primera vez a Omega Red, un antiguo operativo soviético quien es vuelto a la vida, y que conocería a Wolverine de años antes. Se descubre que Wolverine fue parte de un grupo especial de la CIA llamado Team X junto a Sabretooth y Maverick.

Uncanny Xmen #282-287
Publicación: 1992
Guion: John Byrne
Arte: Whilce Portacio

40 años en el futuro un mutante prófugo llamado Trevor Fitzroy con la capacidad de generar portales para viajar en el tiempo, se escapa a nuestra era junto a varios prófugos de la justicia. Es seguido en el tiempo por Bishop, Malcom y Randall , policías mutantes de una fuerza de Ley llamada XSE (Xavier Security Enforces) quienes buscan ejecutarlo. Si bien Malcom y Randall mueren en el presente, Bishop se enfrenta a los X-Men, pero éste los admira ya que en su época son conocidos como leyendas. Finalmente, varado en esta época, pasa a formar parte de los X-Men.
Antes de viajar en el tiempo, Bishop en el futuro encontró una grabación donde Jean Grey advierte que los X-Men han sido asesinados por un traidor. Bishop cree que el traidor es Gambit, ya que es el único que aún vive en el futuro del cual proviene.

X-Men #008-009
Publicación: 1992
Guion: Jim Lee, Scott Lobdell
Arte: Jim Lee

Se descubre que Gambit tiene una esposa, de un matrimonio por conveniencia debido a una alianza entre su gremio de ladrones con el gremio de asesinos de New Orleans, quienes a su vez deben rendir tributo a Candra, una mutante X-ternal, que les hace creer que es una diosa.

X-Men Annual vol 2 #001, Uncanny X-Men Annual #016, X-Factor Annual #007, X-Force Annual #001
Publicación: 1992
Guion: Fabian Nicieza
Arte: Jae Lee, P. Craig Russell, Brian Stelfreeze, Adam Hughes, Stuart Immonen, Dan Panosian, Greg Capullo, Mark Texeira, Joe Quesada

Los diversos grupos X viajan a mundo Mojo donde entre otras cosas descubrimos el origen y la relación de padre/hijo de Shatterstar miembro de X-Force con Longshot, antiguo miembro de los X-Men.

Cable: Blood & Metal #1-2
Publicación: 1992
Guion: Fabian Nicieza
Arte: John Romita Jr.

Elaborada historia donde conocemos parte del pasado de Cable en esta era, como miembro de un grupo de mercenarios llamado Six Pack, donde junto a Domino, Hammer, GW Bridge, Grizzly y Kane, y realizando diversas misiones paramilitares, se topan en el pasado con Stryfe. Para detenerlo debe sacrificar a su grupo, mientras en el presente cuenta la historia de cómo nuevamente debe enfrentarse a Stryfe y descubre que este tiene su mismo rostro, sin saber por qué.

Uncanny X-Men #294-297, X-Men #014-016, X-Factor #084-086, X-Force #016-018
Publicación: 1992
Guion: Scott Lobdell, Fabian Nicieza, Peter David
Arte: Brandon Peterson, Andy Kubert, Jae Lee, Greg Capullo

En medio de un concierto de Rock de Lila Cheney, el profesor Charles Xavier da un discurso sobre la tolerancia y la diversidad pero es víctima de un atentado.
Las cámaras muestran que el causante del ataque es Cable quien desaparece sin dejar rastro. Los X-Men, junto con X-Factor, buscan a Cable y a su equipo X-Force para ser juzgados, ignorando que en realidad el causante es Stryfe, quien entre otras cosas manipula a Mr Sinister y a los jinetes oscuros (Dark Riders, mutantes terroristas seguidores de Apocalypse), secuestra a Jean Grey y a Cyclops, y se enfrenta Apocalypse dejándolo a punto de morir.
Mientras Xavier es salvado por Apocalypse, se descubre que Cable y Stryfe son uno clon del otro, sin saber cuál es cual, y ambos provienen del futuro.
Stryfe y Apocalypse aparentemente mueren, y Cable es absorbido por un vórtice en el tiempo. Para peor, se libera el Legacy Virus en el ambiente.

Uncanny Xmen #303
Publicación: 1993
Guion: Scott Lobdell
Arte: Richard Bennett

El Legacy Virus o virus del legado, creado por Stryfe, se propaga en el aire y contagia a los mutantes. El modo de actuar es acentuando su capacidad mutante al máximo dejándolo fuera de control, momento en el cual el mutante eventualmente muere. Illyana Rasputin, hermana de Colussus, contrae el virus, y luego de un tiempo finalmente también muere.

X-Force #020-022
Publicación: 1993
Guion: Fabian Nicieza
Arte: Greg Capullo

Graymalkin es la estación espacial de Cable, también proveniente del futuro, que entre otras cosas otorgaba al mutante la capacidad de viajar en el tiempo y teletransportarse. Cable, luego de la canción del verdugo (X-Cutioner’s Song) es dado por muerto y su estación en estado de abandono es encontrada por S.H.I.E.L.D. en el espacio. Frente a esto X-Force decide destruir Graymalkin, para que nadie se apropie de ella: el núcleo de desplazamiento temporal es destruido y enviado al fondo del Océano Pacífico. Los restos de la estación quedan a la deriva en el espacio, los cuales serían encontrados por Magneto, (quien se cree está muerto luego de la caída de su asteroide M) para crear Avalon.

Deadpool: The Circle Chase #001-004
Publicación: 1993
Guion: Fabian Nicieza
Arte: Joe Madureira

Primera miniserie de Deadpool, en ella conoceríamos que un importante mafioso llamado Tolliver ha muerto a manos de Cable anteriormente y ha dejado un importante testamento oculto. Decenas de mercenarios buscan su legado, sin saber que este legado es el androide Zero, fuente infinita de conocimiento del futuro además con la facultad de inhabilitar cualquier arma. Zero se vuelve independiente, y posteriormente se descubriría que Tolliver no ha muerto y es en realidad Tyler Dayspring. El hijo de Cable, proveniente desde el futuro lejano.

X-Factor #092, X-Force #025, Uncanny X-Men #304, X-Men #025, Wolverine #075, Excalibur #071
Publicación: Año 1993
Guion: J.M. DeMatteis, Larry Hama, Scott Lobdell, Fabian Nicieza
Arte: Richard Bennett, Greg Capullo, Roger Cruz, Jan Duursema, Adam Kubert

X-Factor se enfrenta a los Acólitos de Magneto, y aparece Exodus por primera vez. Cable regresa después de haber sido dado por muerto en X-Cutioner’s Song, y junto a X-Force es derrotado por Magneto quien lo deja a punto de morir. En medio del funeral de Illyana Rasputin reaparece Magneto públicamente, se enfrenta a los X-Men ofreciéndoles santuario en su nuevo asteroide Avalon. Colossus abandona a los X-Men y se une a los acólitos de Magneto.
Posteriormente, una avanzada de X-Men encabezada por Charles Xavier, utilizando un exoesqueleto que le permite caminar, viajan a Avalon donde enfrentan a Magnus.
Magneto arranca el Adamantium a Wolverine, con lo que descubriremos que bajo el esqueleto de metal Logan tiene huesos, y éstos estaban forrados.
Charles Xavier derrota a Magneto dejándolo en estado vegetal, mientras Exodus desenmascara a Fabian Cortez, quien buscaba en realidad la muerte de Magneto para ganar la competencia de los Upstarts.
Wolverine luego de recuperarse decide independizarse de los X-Men por un tiempo.
Excalibur intenta recuperar a Colossus, quien rechaza volver.
Avalon sobrevive con los acólitos cuidando de Magneto en estado vegetal.

Avengers #368-369, X-Men #26, Avengers West Coast #101, Uncanny X-Men #307, Black Knight: Exodus #001
Publicación: 1993
Guion: Bob Harras, Scott Lobdell, Fabian Nicieza, Ben Raab, Roy Thomas
Arte: Jim Cheung, Jan Duursema, Steve Epting, Andy Kubert, John Romita, Dave Ross

Inmediatamente posterior a Atracciones Fatales, Fabian Cortez, desesperado por su derrota en los Upstarts, lidera una facción rebelde en medio de la guerra civil en Genosha y posteriormente secuestra y pretende matar a Luna, la hija de Quicksilver y Crystal (y nieta de Magneto). Lo que provoca un enfrentamiento con los Avengers, los X-Men y los Acólitos comandados por Exodus.

Cable #006-008
Publicación: 1993
Guion: Fabian Nicieza
Arte: Dwayne Turner

Se descubre finalmente la verdadera historia de Cable en el futuro: él es Cristopher Nathaniel Summers, hijo de Cyclops y Madelyne Pryor, que al ser enviado 2000 años al futuro con Askani para salvarse del tecnovirus, es clonado temiendo que no pudiera ser salvado. El clon sería Stryfe, y el original infectado sería Cable.
Stryfe sería arrebatado de las hermanas Askani por parte de Apocalypse quien reina en el futuro y sería criado a su imagen y semejanza con el fin de servir de nuevo cuerpo recipiente para Apocalypse.
Mientras que el pequeño Christopher Nathaniel viviría de forajido perteneciente a la facción rebelde hasta convertirse en el soldado conocido como Cable.
Se descubre que su hijo en el Futuro, Tyler Dayspring, habría sufrido un lavado de cerebro por parte de Stryfe y habría viajado hasta el presente.

X-Men #030
Publicación: 1994
Guion: Scott Lobdell
Arte: Andy Kubert

Cyclops y Jean Grey finalmente se unen en matrimonio. A la boda asisten miembros de diversos grupos-X. El ramo es atrapado por Rogue y la liga es tomada por Gambit. Sabretooth, quien durante esa época está como prisionero al cuidado de Charles Xavier intentando rehabilitarlo, planea hacer algo que arruine el momento, pero es detenido por Wolverine, quien no asiste a la boda pero merodea cerca, luego de haber renunciado al grupo tras los eventos de Atracciones Fatales.
El Vals elegido por los novios es la canción One de la banda U2.

Wolverine #079
Publicación: 1994
Guion: Larry Hama
Arte: Adam Kubert

Cyber, un villano corpulento con los brazos recubiertos en Adamantium se enfrenta a Wolverine y rompe sus garras de hueso. Wolverine sin el adamantium coaccionando su cuerpo, comienza a tener un cambio poco a poco mas agresivo.

X-Force #032-037, X-Force Annual #003, New Warriors #045-046
Publicación: 1994
Guion: Jim Krueger, Fabian Nicieza
Arte: Tony Salvador Daniel, Arnie Jorgenson, Brandon McKinney, Paul Pelletier, Darick Robertson

X-Force y los New Warriors se enfrentan a Trevor Fitzroy y al omniopata Amo del juego (Gamesmaster)

Uncanny X-Men #316-317, X-Men #036-037, X-Factor #106, X-Force #038, Excalibur #82, Wolverine #85, Cable #16
Publicación: Año
Guion: Todd DeZago, Scott Lobdell, Fabian Nicieza
Arte: Roger Cruz, Tony Salvador Daniel, Terry Dodson, Jan Duursema, Steve Epting

Emma Frost, luego de haber salido de su estado catatónico de meses, se encuentra junto a Banshee, Sabretooth y Jubilee con una mansión X infestada de la tecnoraza alienígena Phalanx suplantando a los X-Men, que al parecer han sido secuestrados. Ellos 4 tienen la misión de ir en busca de la nueva generación de X-Men que tenía en mente el Profesor Xavier pues temen que Phalanx también los quiera asimilar. Por otro lado X-Factor, Excalibur, y X-Force se unen para enfrentarse a esta raza, mientras Wolverine y Cable se unen en la Isla Muir para luego viajar al monte Everest y rescatar a los X-Men secuestrados.
Cameron Hodge, antiguo creador de la X-Tintion Agenda es sepultado en el monte Everest. Aparece por primera vez Blink, quien muere sacrificándose, y los jóvenes miembros de la futura Generation X.

Uncanny X-Men #318, Generation X #001 en adelante
Publicación: 1994
Guion: Scott Lobdell, Fabian Nicieza
Arte: Chris Bachalo, Roger Cruz, Andy Kubert, Joe Madureira

La nueva generación de mutantes que apareció en la Alianza Falange se integra a los X-Men. Se decide crear la Escuela de Masachusetts para jóvenes mutantes, conocida como Generación X, dirigida por Emma Frost y Banshee. Jubilee pasaría a formar parte del grupo, cuya alineacion se completaría con Paige Guthrie, Sincro, Chamber, Skin, Monet y Penance. Su némesis sería Emplate, un mutante multidimensional que se alimenta de la médula de otros mutantes.

X-Factor #100-111
Publicación: 1994
Guion: J.M. DeMatteis
Arte: Jan Duursema

Producto de un viaje a Genosha, Multiple Man se expone demasiado a otros mutantes enfermos y termina contrayendo el Legacy Virus, por lo que eventualmente muere. Posteriormente, Strong Guy absorbe demasiada energía cinética al recibir el impacto directo del derrumbe de un edificio, sufriendo un ataque cardíaco que lo deja catatónico.

Cable #017-019
Publicación: 1994
Guion: Jeph Loeb
Arte: Steve Skroce

Cable, junto a Storm y Caliban, viajan a Akkaba en Egipto en busca de los jinetes oscuros (Dark Riders) pues aparentemente Apocalypse ha vuelto, reclutando jinetes nuevos. Sin embargo no es Apocalypse, sino Tyler Dayspring, el hijo de Cable, quien dando por muerto a Apocalypse se autoproclama su heredero y se hace llamar Genesis.

X-Factor #109, Uncanny X-Men #320-321, X-Men #040-041, Cable #020
Publicación: 1995
Guion: Scott Lobdell, Mark Waid, Fabian Nicieza
Arte: Roger Cruz, Ron Garney

Legion, el hijo de Charles Xavier, ha salido de su estado catatónico. Decide desencadenar su poder y viajar al pasado a la época en que su padre y Magneto eran amigos en Israel, para así matar a Magneto cuando joven, de este modo nadie se opondría a las ideas de Charles Xavier y se haría realidad su mundo de coexistencia pacífica entre humanos y mutantes. Sin embargo sus acciones provocan todo lo contrario: al cambiar la historia nunca hubo una Phoenix que arreglara el Cristal M´Krann hace años, por lo cual este cristal nexo de las realidades se destruye y explota, cristalizando paulatinamente todo el universo, expandiéndose.
Mientras, en el pasado, Legion se enfrenta a un inexperto Magneto y pretende matarlo, pero Bishop junto a otros X-Men son enviados a detenerlo.
Legion intenta matar a Magneto con un cuchillo psíquico pero Xavier se cruza para salvar a su amigo por lo que recibe el ataque y muere.
Al morir Charles Xavier, Legion desaparece, pues nunca nació, mientras que Magneto sobrevive.
En las sombras queda Bishop, quien al ya haber sido un viajero en el tiempo se transforma en una anomalía cronal, y único testigo de cómo debiera ser todo.
Mientras tanto en el presente los X-Men resignados a que no pudieron hacer nada en el pasado y a morir, esperan que llegue la oleada del cristal M´krann a destruir toda la realidad.
En el ultimo instante Rogue y Gambit deciden darse un beso antes de morir.

X-Men Chronicles #001-002
Publicación: 1995
Guion: Howard Mackie
Arte: Terry Dodson

Magneto, en honor a Charles Xavier, decide hacer realidad el sueño de este. Funda los X-Men y crea un enorme complejo lleno de estudiantes en medio de la montaña Wundagore, alejados del mundo. Sus miembros son Jean grey, Colossus, Quicksilver, Iceman, Storm y Scarlet Witch, al que unen una joven Rogue al grupo y un incontrolable Weapon X (Wolverine).
Mientras tanto en EEUU aparece la Nave de Apocalypse quien junto a sus jinetes Sabretooth, Gideon, Candra, War y Death, intentan invadir y apoderarse del arsenal nuclear del país del norte. Los X-Men viajan a detenerlos y dejan a Rogue y a Scarlet Witch a cargo de la escuela y sus jóvenes niños estudiantes en la montaña Wundagore, pero el poderoso hijo de Apocalypse, Nemesis, los espía desde las montañas.
En las filas del poderoso mutante egipcio, Sabretooth se niega a que las armas nucleares sean lanzadas contra el mundo, por lo que lo traiciona. Aun así los X-Men lo derrotan y derrotan a Apocalypse y sus jinetes. Sin embargo con el tiempo el tirano dominaría de todos modos, y los X-Men al volver a casa encontrarían toda la escuela destruida a manos de Nemesis, quien huyó apenas sobreviviendo por las heridas causadas por Rogue, única sobreviviente, pues Scarlet Witch se encuentra agonizando y finalmente muere, como el resto de los niños estudiantes que los X-Men dejaron en Wundagore.

Un par de años más tarde Apocalypse ya ha dominado gran parte del mundo y los X-Men regresan de una batalla en la cual sobrevive Weapon X, quién por si solo se ha enfrentado a las tropas de Apocalypse para rescatar a Jean Grey, la cual se cuenta habría sido prisionera de Cyclops, uno de los sirvientes de Apocalypse. En el enfrentamiento Weapon X perdió una de sus manos y los ligamentos que unen sus huesos de esta, y Cyclops pierde un ojo.

Jean y Weapon X abandonan el grupo volviéndose independientes mientras que Sabretooth, luego del enfrentamiento hace años, termina uniéndose a los X-Men. Gambit después de un tiempo de unirse al grupo decide abandonarlos, pues su gran amigo Magneto inicia una relación con la mujer que él ama, Rogue.

A través de otras imágenes promocionales y algunos flashbacks sabemos otras cosas que pasaron fuera de cuadro como: Nemesis sobrevive al enfrentamiento con Rogue, pero se hace un traje contenedor para sobrevivir y contener su inmenso poder, a partir de ahí se hace llamar Holocaust.
Exodus es rescastado por Magneto de manos de los Madri, unos fanáticos religiosos a las ordenes de Apocalypse.
Chamber es rescatado de las tropas de Apocalypse, junto a otros mutantes jóvenes.
Morpho, un mutante con la capacidad de cambiar de apariencia se une al grupo, además de otros mutantes como kitty Pride, Banshee, Sunfire, Dazzler y Nightcrawler.
Sabretooth rescata a Blink, y además adopta a Wild Child.
Colossus se enfrenta a Mikail Rasputin, su hermano y uno de los jinetes de Apocalypse. En el enfrentamiento pierde partes de su cuerpo, por lo que son reemplazadas con acero de color rojo.
Rogue y Magneto tienen un hijo al cual llaman Charles.

X-Men: Alpha #1
Publicación: 1995
Guion: Scott Lobdell, Mark Waid
Arte: Roger Cruz, Steve Epting

Apocalypse domina gran parte de Norteamerica, el resto del mundo es un caos y solo sobrevive aún parte de Euroasia.
Bishop ha vagado todo este tiempo (desde la Búsqueda de Legion) recordando a medias lo que realmente ocurrió.
Se enfrenta con un grupo de Infinites (soldados de Apocalypse) y se encuentra con los X-Men por primera vez.
Bishop culpa de todo esto a Magneto y les cuenta todo lo que sabe, como deben ser las cosas, para cerciorarse de que no miente Rogue lo toca, absorbiendo parte de sus memorias por lo que descubren que dice la verdad.
Magneto confía en la versión de Bishop, pero aun así este es su mundo y debe luchar por él, por lo que decide organizar a los X-Men en diversas misiones estratégicas.
Conocemos a los 4 jinetes de Apocalypse: Mikail Rasputin, Abiss, Holocaust y Sinister. Además, el villano cuenta con algunos lugartenientes como Cyclops y Dark Beast.

The Astonishing X-Men #1-4
Publicación: 1995
Guion: Scott Lobdell
Arte: Joe Madureira

Magneto reúne a sus X-Men encomendándoles diversas misiones.
El grupo comandado por Rogue, Sunfire, Morph, Blink, Sabretooth y WildChild se interna en el continente con el fin de detener las cosechas, matanzas en serie de Apocalypse, Sabretooth se enfrenta con Holocaust. Y pretenden destruir una fábrica de Infinites.

The Amazing X-Men #001-004
Publicación: 1995
Guion: Fabian Nicieza
Arte: Andy Kubert

Los X-Men se enteran de que el Gobierno Humano de Euroasia pretende atacar con un arsenal nuclear toda Norteamérica, por lo que se inicia un rescate de sobrevivientes a gran escala antes del bombardeo, a través de centinelas enviados por los humanos.
El grupo liderado por Storm y Quicksilver, junto a Banshee, Dazzler, Exodus y Iceman se involucran en la gran huida de los humanos y se enfrentan a Abiss. Nanny, el robot protector de Charles inicia los protocolos de defensa ya que Apocalypse se dirige a la Mansión, en la cual se enfrenta a Bishop y a Magneto.

Weapon X #001-004
Publicación: 1995
Guion: Larry Hama
Arte: Dan Green, Karl Kesel, Andy Kubert, Chris Warner

Jean Grey y Weapon X, pasan a ser espías y mercenarios del Alto Consejo Humano de Euroasia, llevando información desde y hacia Norteamérica. Al enterarse de que el Alto Consejo pretende desencadenar un holocausto nuclear en la Norteamérica que se encuentra dominada por Apocalypse, Jean y Weapon X se separan, pues Jean pretende ir a ayudar en la evacuación y Weapon X pretende encontrar a Gateway, un mutante con el poder suficiente de crear un portal para así enviar las armas nucleares antes de que puedan ser detectadas por Apocalypse.

Gambit and the X-Ternals #001-004
Publicación: 1995
Guion: Fabian Nicieza
Arte: Tony Salvador Daniel

Para corroborar la versión de Bishop y ayudar a arreglar la situación, Magneto vuelve a ponerse en contacto con Gambit después de años y le pide que junto a sus aliados, unos forajidos llamados los Externos (entre los que están Sunspot, Lila Cheney, Jubilee y Strong Guy) puedan viajar hasta el otro confín de la galaxia, internarse en el Imperio Shiar y robar una astilla del poderoso Cristal M´Krann.

Generation Next #1-4
Publicación: 1995
Guion: Scott Lobdell
Arte: Chris Bachalo

Colossus junto a Kitty Pryde, quienes preparan a la nueva generación de jóvenes hombres x, son contactados por Magneto para pedirles que viajen al Núcleo , una especie de gigantesca central minera  al mando de un mutante llamado del Sugar Man, donde tienen esclavizados a mutantes para la producción, todo dirigido para abastecer el imperio de Apocalypse. Su misión será infiltrarse ahí en busca de la joven Illyana Rasputin pues es la única mutante viva que podría tener la capacidad latente de alterar la realidad o viajar en el tiempo. Es una misión suicida y la robot omnisciente denominada sabelotodo indica que la probabilidad de éxito es de un 0.000 %

X-Calibre #001-004
Publicación: 1995
Guion: Warren Ellis
Arte: Ken Lashley

Por petición de Magneto, Nightcrawler junto a Mystique inician un viaje hasta un punto de la Savage Land, en medio de la Antártica, denominado Avalón. Allá son ayudados por Caín Marco para encontrar a Destiny, una vidente con la cual Magneto pretende saber las consecuencias de intentar cambiar las cosas indicadas por Bishop. Son seguidos por Dead Man Wade (Deadpool) quien por órdenes de Apocalypse debe impedir que logren su objetivo y matar a todos en el lugar.

Factor X #001-004
Publicación: 1995
Guion: John Francis Moore
Arte: Steve Epting

Al interior del imperio formado de Apocalypse, vemos distintos mutantes involucrados en su gobierno. Havok liderando un grupo autoritario manteniendo el orden de Apocalypse. Dark Beast, quien realiza diversos experimentos sin ética ni moral con los prisioneros humanos o mutantes. Cyclops quien duda de su lealtad a Apocalypse y motivado con la reaparición de Jean Grey pretende liberar a los prisioneros de los corrales o campos de concentración, y finalmente Sinister, quien sabe que el camino de Apocalypse no llevará a ningún lugar por lo que comienza a realizar planes propios.

X-Universe #001-002
Publicación: 1995
Guion: Terry Kavanagh, Scott Lobdell
Arte: Carlos Pacheco

En esta historia sabemos qué fue de todos los otros héroes no mutantes en la Era de Apocalypse, como muchos de ellos murieron y otros planean aliarse con Mikail Rasputin uno de los jinetes de Apocalypse.

X-Man #001-004
Publicación: 1995
Guion: Jeph Loeb
Arte: Steve Skroce

En el primer encuentro años atrás entre Cyclops y Jean Grey, cuando esta fue retenida por las fuerzas de Apocalypse, Sinister alcanzó a tomar muestras de su ADN.
Sinister posteriormente usaría estas muestras junto a las de Cyclops para diseñar genéticamente un mutante superior que el pudiese utilizar en contra de Apocalypse.
Este mutante es Nate Grey, alias X-Man, quién se libera tempranamente y huye junto a sus compañeros itinerantes y es ayudado por su mentor Forge.
Sinister, al ir en su búsqueda, mata eventualmente a sus amigos y finalmente es asesinado por X-Man, quien no contento con matar a Sinister, busca enfrentar y matar al mismo Apocalypse.

X-Men Omega #001
Publicación: 1995
Guion: Scott Lobdell, Mark Waid
Arte: Roger Cruz

Apocalypse ha intervenido los planes de los X-Men. Ha robado la astilla del Cristal M´Krann obtenida por Gambit y además tiene a Magneto prisionero, torturándolo.
Todos los X-Men van a la ciudadela de Apocalypse y se encuentran con que ha habido un motín liderado por Cyclops y Jean Grey quienes han liberado a los prisioneros.
En lo alto de la ciudadela de Apocalypse, el Angel, que todo este tiempo ha estado al margen del conflicto, se suicida con un chaleco con explosivos volando hacia el generador de seguridad de la ciudadela haciéndolo estallar.
Esto permite a los X-Men oportunamente ingresar a la base de Apocalypse, pero no sólo a ellos, sino también al solitario X-Man en busca de venganza.
X-Man junto a Magneto pelan contra Holocaust y Apocalypse.
Los X-Men en la sala del Cristal M´Krann, junto con Destiny y con Illyana Rasputin corroboran que todo lo dicho por Bishop es cierto y lo envían a través del Cristal al pasado a detener a Legion e impedir que mate a Charles Xavier. Bishop lo consigue y Legion es consumido por sus propios poderes, esto provoca que la línea temporal original sea restaurada.
Mientras tanto en la Era de Apocalypse, Sugar Man escondido en la bota metálica de Colossus en un tamaño enano salta hacia el interior del Cristal M´Krann.
Lo mismo hace Dark Beast al intentar escapar y se teletransporta por accidente hacia el cristal.
X-Man para atacar a Holocaust rompe una astilla del cristal y se la entierra en el pecho. Esto provoca que, al igual que Sugar Man y Dark Beast, ellos desaparezcan (luego descubriríamos que lo que pasó es que ellos 4 fueron transportados a nuestra era).
Jean Grey utiliza su poder al máximo para mantener a raya las bombas nucleares que el Alto Consejo humano ya han soltado sobre Norteamérica, pero es asesinada por Havok, por lo que las bombas comienzan a caer. Havok y Cyclops se matan mutuamente, mientras Weapon X desciende sobre Norteamérica en paracaídas a morir con Jean Grey, de quién se alcanza a despedir agonizante.
Magneto finalmente mata a Apocalypse, y conforme con haber cumplido lo planteado por Bishop para restaurar su era, contempla abrazando a su amada Rogue y a su hijo como caen las bombas nucleares sobre Norteamérica, ya resignados a morir. En medio del holocausto Magneto, junto a su familia, piensa y agradece a Charles Xavier por haberlo salvado y haber cambiado así su vida.