X-Men Prime #1
Publicación: 1995
Guion: Scott Lobdell
Arte: Terry Dodson, Gary Frank, Eduardo Herrera, Bryan Hitch, Jeff Matsuda, y más.

Una vez terminada la Era de Apocalipsis y restaurada la realidad normal, vemos qué fue de cada uno de los grupos X. Esta etapa es conocida como Marvelution y vincula cada una de las colecciones mutantes en paralelo. Principalmente la historia nos muestra algunos eventos importantes: la Doctora MacTaggert termina contrayendo el Virus del Legado producto de su exposición reiterada al virus, a pesar de que ella sea humana y no mutante. Nos enteramos de que 4 personajes saltaron desde la Era de Apocalipsis a nuestra realidad: Sugar Man (El Hombre de Azúcar) y Dark Beast (Bestia Oscura) llegaron a nuestra realidad hace más de 20 años, Sugar Man sería el creador oculto del proceso de mutados de Genosha, mientras que quien estaría detrás de la creación de los morlocks se descubre que habría sido Dark Beast con sus experimentos.
Por otro lado, los acólitos de Magneto descubren flotando en el espacio un trozo gigante de hielo con vida adentro, quien sería en realidad Holocaust que habría aparecido en el espacio. Mientras en la Tierra también luego de aparecer en el espacio se estrellaría X-Man.

X-Men vol 2 #42-44
Publicación: 1995
Guion: Fabian Nicieza
Arte: Paul Smith

Los acólitos llevan a su estación espacial Avalon al ser encontrado congelado en el espacio, que resulta ser Holocaust. Este se libera y mata a varios Acólitos enfrentándose a demás mano a mano contra Exodus. La base se destruye y entre los que logran huir se cuenta a Colossus, quien desde Atracciones Fatales comenzó a formar parte de ese grupo, y Magneto en sus brazos, quien aún está desde ese mismo evento en estado vegetal.

X-Man #5 en adelante
Publicación: 1995
Guion: Jeph Loeb
Arte: Steve Skroce

El joven conocido como X-Man, o Nate Grey, cae en medio de los Alpes Suizos, desde ahí comienza un viaje intentando saber donde está y qué hacer. En su historia nos encontramos cómo se presenta a diversos personajes, como a Dark Beast, el mismo Charles Xavier, Excalibur y otros.
Con sus poderes psiónicos logra dar vida nuevamente a una imagen cercana, sin quererlo, por lo que traería de vuelta a la vida a Madelyne Pryor.

Uncanny X-Men #322
Publicación: 1995
Guion: Scott Lobdell
Arte: Tom Grummett

Los X-Men se enfrentan a Juggernaut quien se encuentra aterrado ya que alguien lo golpeó y lo hizo volar a través de varios estados de EEUU. Los X-Men le preguntan quién fue, a lo que antes de desmayarse logra solo decir su nombre: Onslaught

X-Men #45
Publicación: 1995
Guion: Fabian Nicieza
Arte: Andy Kubert

Antes de que comenzara la Era de Apocalipsis, Gambit besó apasionadamente por primera vez a Rogue. Al ser restaurada la realidad vemos que Rogue ha absorbido parte de las memorias de Gambit y parte de sus poderes, por lo que decide abandonar el grupo. Gambit trata de razonar con ella pero no logra hacerla cambiar de opinión y terminan su relación.
Se descubre que Sinester conoce a Gambit con anterioridad y entre ellos hay temas pendientes.

X-Force #44
Publicación: 1995
Guion: Jeph Loeb
Arte: Adam Pollina

Los miembros de X-Force dejan de ser fugitivos y junto a cable pasan a usar un uniforme y a alojarse temporalmente en la Mansión junto a los X-Men. Cable y Xavier llegan a un entendimiento y deciden además que Cannonball pase a ser miembro de los X-Men.
Rictor abandona el grupo.

X-Factor #112-117
Publicación: 1995
Guion: John Francis Moore
Arte: Steven Epting

El grupo perteneciente al gobierno a pasado a ser guiado por Forge, quien además incluye en sus filas a Mystique quien posee un implante en el cerebro que le causa dolor cada vez que intente hacer algo en contra del grupo, por lo que pasa a formar parte contra de su voluntad. Comienzan una relación sentimental sutil. Se unen posteriormente Aurora de Alpha Flight y Wild Child. Havok comienza a tener problemas con sus poderes.

Uncanny X-Men #327
Publicación: 1995
Guion: Scott Lobdell
Arte: Roger Cruz

En medio de un poblado en Sudamérica, una religiosa encuentra a un joven de pelo blanco y poderes magnéticos, quien no posee memoria. Se cree que puede ser Magneto rejuvenecido, que sobrevivió a la destrucción de Avalon. La religiosa lo llama Joseph y le recomienda buscar a los X-Men, quienes poseen poderes al igual que él.

Wolverine vol 2 #91-92; X-Force vol 2 #45, 48; Uncany X-Men #326, 328; Sabretooth Special #1
Publicación: 1995
Guion: Varios
Arte: Varios

Luego que Wolverine le causara una lobotomía al traspasar sus garras por su cerebro, Sabretooth ha cambiado al nivel mental de un niño y se encuentra enclaustrado en la sala del peligro. Wolverine regresa al grupo paulatinamente y al igual que Gambit desconfían de la rehabilitacion que tiene Sabretooth.
Boomer, de X-Force, se encariña con él y termina liberándolo sin querer. Psylocke queda a punto de morir y los X-Men originales se organizan para detenerlo. Sabretooth sería entregado al gobierno y lo ingresarían en X-Factor.

Generation-X #5-6, Uncanny X-Men #322-325
Publicación: 1995
Guion: Scott Lobdell
Arte: Chris Bachalo, Joe Madureira, Bryan Hitch

Una nueva generación de morlocks se comienza a alzar liderados por Marrow y realizan acciones terroristas contra los humanos. Generación X se enfrenta a ellos y posteriormente los X-Men.
Storm como ex líder Morlock se enfrenta a Marrow y le arranca el corazón.

Excalibur #88-90; Pryde & Wisdom #1-3
Publicación: 1995
Guion: Warren Ellis
Arte: Terry Dodson

Las aventuras de Excalibur se cruzan con un ex agente británico llamado Peter Wisdom, quien comienza a formar parte del grupo y comienza una relación con Kitty Pryde, con la desaprobación de la mayoría del grupo. Juntos harían una excelente dupla en distintas misiones secretas.

Excalibur #91-92
Publicación: 1995
Guion: Warren Ellis
Arte: Casey Jones

Luego de sobrevivir a la destrucción de Avalon, Colossus decide no unirse a los X-Men y en su lugar va a Excalibur a buscar el consejo de amigos como Nightcrawler y su amada Kitty Pryde. Al ver que Kitty está en una nueva relación amorosa Colossus se descontrola y termina por enfrentarse a Peter Wisdom. Posteriormente también se une a Excalibur.

Excalibur #87; Cable #22, #26-28
Publicación: 1995
Guion: Jeph Loeb
Arte: Ian Churchill, Tim Sale

Se descubre que Genosha en realidad posee su tecnología para desarrollar el proceso de mutados gracias a alguien oculto en el gobierno, que sería Sugar Man, quien desde hace 20 años se encontraría detrás de todo. Cable junto a Domino lo enfrentarían en Genosha en medio de la guerra civil entre mutados y magistrados del gobierno.

Cable #30-31; X-Man #14
Publicación: 1996
Guion: Terry Kavanagh, John Ostrander
Arte: Steve Skroce

Cable guiado por su aliado/mentor Blaquesmith conocen a X-Man quien no confía en ellos y termina por enfrentarlos, extrañados por ser genéticamente iguales. Al enfrentamiento se une Exodo, quien ha sobrevivido a la destrucción de Avalon.

Wolverine #96-100
Publicación: 1996
Guion: Larry Hama
Arte: Adam Kubert

Wolverine se ve envuelto en una serie de situaciones que lo llevan a enfrentar a Genesis, quien se ha proclamado el sucesor de Apocalipsis y lo quiere como jinete oscuro. Genesis mata a un antiguo enemigo de Wolverine llamado Cyber que también posee adamantium, para así injertarlo nuevamente en Wolverine quien lo perdió en atracciones fatales a manos de Magneto. Wolverine con una extrema fuerza de voluntad logra rechazar el injerto del metal y sobrevivir al proceso, volviéndolo a un estado feral, casi animal. Wolverine con la ayuda de Canonball logra sobrevivir y matar a todos los jinetes oscuros, finalmente también a Genesis. Posteriormente Wolverine volvería después de un tiempo a su estado normal con la ayuda de Elektra.

Excalubur #96-100
Publicación: 1996
Guion: Warren Ellis
Arte: Casey Jones

El Club fuego Infernal posee una sofisticada rama inglesa que pretende, entre otras cosas, llevar el caos a Inglaterra usando la tecnología de Douglock. Los miembros de Excalibur terminarían enfrentándolos en una intensa e interesante aventura.

X-Men v2 #50
Publicación: 1996
Guion: Scott Lobdell
Arte: Andy Kubert

Los X-Men son secuestrados y enfrentados a un poderoso mutante llamado Fortaleza, o Post, quien los somete a un enfrentamiento duro, solo con la intención de estudiarlos, ya que en realidad fortaleza ha sido enviado por Onslaught

Abarcó casi todo los títulos Marvel, pero la saga en sí se desarrolla solo en los números: Onslaught X-Men, X-Men #53-56, Uncanny X-Men #334-336, X-Force #57-58, Avengers 401-402, Fantastic Four #415, Cable #34-35, Incredible Hulk #444-445, X-Factor #125-126, Amazing Spider-man #415, Spider-man #72, X-Man #18-19, Iron Man #332, Wolverine #104-105, Excalibur 100, Marvel Onslaught Universe
Publicación: 1996
Guion: Peter David, Terry Kavanagh, Scott Lobdell, Jeph Loeb, Mark Waid
Arte: Mike Deodato Jr., Pasqual Ferry, Adam Kubert, Andy Kubert, Joe Madureira

Juggernaut ha sido el único hasta el momento en ver a Onslaught, pero su imagen quedó borrada de su mente. Con la ayuda de Jean Grey logran identificarlo , quien en realidad termina por ser un ente Psionico creado fortuitamente por Xavier, uniendo parte de su psique con residuos de Magneto que quedó en su mente al apagársela en Atracciones Fatales. Onslaught libera a los Centinelas, secuestra a X-Man para poder incrementar su poder Psionico, secuestra a Franklin Richards para usar su poder de alterar la realidad y se enfrenta a los X-Men, los Avengers y los Fantastic Four, entre otros.
Finalmente Onslaught es derrotado gracias a los héroes No mutantes quienes aparentemente mueren.

Onslaught Epilogue, X-Men #57, #65-69, X-Force #68-69, Uncanny X-Men #346, Wolverine #115-118, Cable #45-47, X-Man # 30, Generation X #26-31
Publicación: 1997
Guion: Tom DeFalco, Larry Hama, Scott Lobdell, Jeph Loeb, Mark Waid
Arte: Ryan Benjamin, Joe Bennett, Bernard Chang, Randy Green, Andy Kubert

Xavier, luego de lo ocurrido con Onslaught, pierde sus poderes y se entrega al gobierno. Es trasladado a unas instalaciones recientes al mando de un hombre llamado Bastion, quien además está al mando de una operación de centinelas nuevos llamada Tolerancia Zero. Con la desaparición de los héroes, los mutantes son culpados por ello y la opinión pública se vuelve negativa lo que provoca finalmente una respuesta por parte del gobierno quien da luz verde a la operación. La mayoría de los X-Men y grupos afines son diezmados y capturados. Cable en solitario intenta destruir los archivos de la mansión X y esto lo lleva a enfrentar a Bastion.

X-Factor #130-136
Publicación: 1997
Guion: Howard Mackie
Arte: Eric Battle

Con la opinión pública y el gobierno en contra de los mutantes, X-Factor comienza a perder el apoyo gubernamental, además Sabretooth se libera y se enfrenta al grupo. De ahí en adelante sus actividades perderían importancia por lo que el grupo, tiempo después de eso, se disolvería.

X-Force #70-71
Publicación: 1997
Guion: John Francis Moore
Arte: Adam Pollina

Posterior a Tolerancia Cero el equipo se reúne , quienes mutuamente desgastados deciden trabajar en solitario, independizándose de Cable, lo cual los lleva a un recorrido itinerante en diversas aventuras por el país.

Uncanny X-Men #347- 350
Publicación: 1997
Guion: Scott Lobdell
Arte: Joe Madureira

Se descubre la relación entre Mr. Siniestro y Gambit.
Algunos de los X-Men son secuestrados en un refugio en la Antártida y obligados a escuchar la confesión de Gambit, quien en el pasado fue el que reunió a los Merodeadores a las ordenes de Mr Siniestro para ejecutar la masacre mutante. El organizador de todo esto es Erik el Rojo, que en realidad es una identidad ficticia, pues se trata en verdad de Magneto, quien se encuentra vivo y mentalmente repuesto. Gambit es abandonado por el grupo.

X-Men #70, Uncanny X-Men #351
Publicación: 1998
Guion: Joe Kelly, Steve Seagle
Arte: Ed Benes, Carlos Pacheco

Posterior a Operación Tolerancia Zero, con algunos miembros aun desaparecidos, otros en la Antártida y la mansión completamente desalojada, ingresan en el grupo: Magott, un mutante que posee 2 orugas gigantes que lo comen todo, Medula, la antigua morlock parte de Gene Nation, y la doctora Cecilia Reyes, una latina que participó en Zero Tolerance ayudando al grupo, con el poder de generar un campo de fuerza. Luego de un tiempo abandonarían el grupo.

Cable #48, 53
Publicación: 1997-1998
Guion: James Robinson
Arte: Jose Ladronn

Luego de independizarse de X-Force, Cable se traslada a la cocina del infierno, donde tiene su base. Ahí conoce a una periodista de un tabloide amarillista, quien erróneamente ha comenzado a seguir a Sebastian Shaw, líder del Club Fuego Infernal, quienes tienen un plan para obtener el poder de Apocalypse.

Excalibur #124-125
Publicación: 1998
Guion: Ben Raab
Arte: Dale Eaglesham

Luego de diversas aventura,s el grupo Excalibur llega a su fin con la boda de Meggan y el Capitan Britania. Otros miembros como Colossus, Kitty Pryde y Nightcrawler, al disolver el grupo, se unirían nuevamente a los X-Men.

Uncanny X-Men #360-364, X-Men #82-84
Publicación: 1999
Guion: Todd DeZago, Joe Kelly, Steve Seagle, Brian K. Vaughan
Arte: Chris Bachalo, Patrick Gleason, Adam Kubert, Brandon Peterson, Steve Skroce

Los X-Men se enfrentan a Cerebro, la máquina para buscar mutantes que ha obtenido vida propia, y buscan a Xavier para lograr detenerlo. Xavier vuelve a los X-Men y recupera sus poderes.

X-Men The Magneto War, X-Men #85-87, Uncanny X-Men #366, 367
Publicación: 1999
Guion: Joe Casey, Alan Davis, Terry Kavanagh, Joe Kelly, Fabian Nicieza
Arte: Jim Cheung, Alan Davis, Adam Kubert, Rick Leonardi, Brandon Peterson

Magneto se enfrenta a Joseph, quien descubrimos es un clon creado hace años. Magneto amenaza con una catástrofe a nivel global si la ONU no responde a sus requerimientos, que consisten en otorgarle soberanía en la nación de Genosha, actualmente devastada en medio de una guerra civil.
Los X-Men no pueden detenerlo y la ONU Accede.
Joseph intentando reparar los daños se sacrifica y muere.

Magneto Rex #1-3
Publicación: 1999
Guion: Joe Pruett
Arte: Brandon Peterson

Magneto es soberano en Genosha y se debe enfrentar a las actuales facciones militares y mutantes en guerra civil.

Uncanny X-Men #372-377, X-Men #95-97, Wolverine #145-147, Cable #73-76
Publicación: 1999-2000
Guion: Chris Claremont, Terry Kavanagh, Fabian Nicieza, Joe Pruett
Arte: Roger Cruz, Alan Davis, Erik Larsen, Rob Liefeld

Apocalypse captura a Wolverine y le devuelve el adamantium, volviéndolo uno de sus Jinetes Oscuros. Planea reunir a diversos mutantes específicos con el fin de otorgarle un poder casi al nivel de los Celestiales. Entre otras cosas Cyclops, en un intento por detener a Apocalypse, se fusiona con él, lo que aparentemente causa la muerte de ambos.

Uncanny X-Men vol1 #377, Wolverine #148, Cable #77, X-Men #98
Publicación: 2000
Guion: Erik Larsen, Alan Davis, Joe Pruett
Arte: Roger Cruz, Alan Davis, Bernard Chang

No confundir con La Era de Apocalipsis (Age of Apocalypse), ya que esta saga no tiene ninguna relación.
Estos son un par de números que muestran realidades alternativas aleatorias como consecuencia del final de la saga Apocalypse: los 12.

X-men #100, Uncanny X-Men #381, Wolverine #150-153, Cable #79
Publicación: 2000
Guion: Chris Claremont, Steve Skroce
Arte: Adam Kubert, Steve Skroce

Pasan 6 meses después de la derrota de Apocalypse y vemos el nuevo status quo de los mutantes, que entre otras cosas han cambiado de uniformes. Cable ha ingresado en los X-Men, Nightcrawler ha iniciado sus estudios como Sacerdot, y se vinculan con personajes nuevos y villanos como los Neo, que no tendrían mayor relevancia.

Generation X #63-75, X-Force #102-115, X-Man #63-75
Publicación: 2000-2001
Guion: Ian Edginton, Warren Ellis, Steve Grant
Arte: Enrique Breccia, Lan Medina, Ariel Olivetti, Whilce Portacio, Ariel Olivetti

Junto a Revolution, 6 meses después de que Apocalypse, es derrotado comienzan a contarse las ultimas historias de Generation X, X-Force y de X-Man. Generation X perdería a Sincro y Emma Frost terminaría por disolver el grupo y cerrar la escuela de Massachusets. X-Force, en su ultima misión, son dados por muertos, y X-Man finalmente se sacrifica y muere enfrentando una amenaza cósmica.

X-Men: The search for Cyclops #1-4
Publicación: 2001
Guion: Joe Harris
Arte: Tom Raney

Se descubre el destino de Cyclops tras aparentemente morir junto a Apocalypse. Posteriormente se dice que producto de haber estado fusionado con él, Cyclops desarrolló una parte mas oscura e intensa que antes no tenia.

Uncanny X-Men #388, Cable #87, Bishop #16, X-Men 108
Publicación: 2001
Guion: Chris Claremont, Robert Weinberg
Arte: Salvador Larroca, Brett Booth, Leinil Francis Yu

Mystique y Sabretooth atacan la Isla Muir, donde muere Moira McTaggart. Muere Pyro, víctima del virus del legado. Mystique mata al Senador Robert Kelly.

Uncanny X-Men #390, X-Men #110
Publicación: 2001
Guion: Scott Lobdell
Arte: Salvador Larroca

Beast, junto con Moira Mactaggart, antes de que ella muriera, logran encontrar la cura del Virus Legado. Sin embargo, aún deben idear una forma de liberarlo en el ambiente, ya que se propagaría del mismo modo en que el virus lo hace, o sea maximizando los poderes de un mutante hasta matarlo. Colossus, conciente de que su hermana murió anteriormente producto de este virus, se niega a la espera sabiendo q alguien mas podría morir en esos momentos, por lo que se inyecta la cura y se sacrifica para expandirla en el ambiente.
Posteriormente Kitty Pryde viajaría a Rusia para esparcir las cenizas de Colossus y abandonaría el grupo.

X-Men #109
Publicación: 2001
Guion: Chris Claremont
Arte: Tom Derenick

Se reúnen para navidad los X-Men y luego de la muerte de Moira, Colossus y el abandono de Kitty Pryde. Algunos deciden tomar un camino distinto del grupo. Principalmente Storm, quien recibe de regalo un nuevo traje. Es el que usaría para posteriormente liderar la futura X-treme X-Men.

X-Force#116-129, X-Statix #1-26
Publicación: 2001
Guion: Peter Milligan
Arte: Mike Allred

Un nuevo grupo de mutantes creados para tener a favor la opinión publica y ser famosos toma el nombre de la difunta X-Force, y posteriormente se pasan a llamar X-Statix. Sus aventuras no influirían en la línea de los X-Men.

Uncanny X-Men #392-393, X-Men #111- 113
Publicación: 2001
Guion: Scott Lobdell
Arte: Salvador Larroca,  Leinil Francis Yu

Han pasado meses desde que Magneto adquirió la soberanía de Genosha, la que actualmente se encuentra alineada a eé y totalmente bajo su mando.
Con los X-Men divididos en su mayoría, Magneto pretende una especie de rebelión mundial desde Genosha, y como ícono de la rebelión secuestra a Xavier y lo expone frente a Genosha derrotado.
Wolverine, Cyclops, Jean Grey y algunos X-Men provisionales como Northstar viajan a la isla para enfrentarlo.
Wolverine logra detener a Magneto rompiendo su columna.

New X-men #114-156
Publicación: 2001-2004
Guion: Grant Morrison
Arte: Frank Quitely, Ethan Van Sciver, Leinil Francis Yu, Igor Kordey, John Paul Leon, Phil Jiminez, Keron Grant

Entre muchas otras cosas importantes, los miembros centrales comienzan a ejercer como profesores y la escuela a funcionar como tal. Xavier se revela públicamente como mutante y abre su escuela al público.
Emma Frost ingresa en los X-Men por primera vez.
Aparece Cassandra Nova, la gemela de Xavier, con poderes psiónicos casi sin límites, quien libera un enjambre de centinelas salvajes en Genosha destruyéndola completamente y matando a más de 15 millones de mutantes. Provoca un enfrentamiento con los Shiar poseyendo a Lilandra Neramani. Aparece Xorn, un supuesto mutante oriental con una estrella en el cerebro capaz de curar a otros y pasa a quedar al mando de una clase especial. Xavier vuelve a caminar gracias a Xorn. Aparecen aquí por primera vez personajes como Kid Omega, Phantomex.
Emma Frost queda como tutora de las Steppford Cuckcoos. Wolverine sabe que en realidad Arma X es parte de un programa del gobierno mas complejo llamado Arma Plus y la X es en realidad el 10, por lo que ha habido muchos sujetos como él, y conoce parte de su pasado.
Jean Grey vuelve a manifestar el poder Fénix, Magneto regresa y destruye parte de New York y mata a más de 5 mil personas. Muere Jean Grey. Wolverine aparentemente decapita a Magneto.
Cyclops comienza una relación sentimental con Emma Frost.

X-Treme X-Men #1-46
Publicación: 2001-2004
Guion: Chris Claremont
Arte: Salvador Larroca, Igor Kordey, Arthur Ranson, Brent Anderson

Storm forma un nuevo grupo separado del de Xavier, conformado por ella, Bishop, Rogue, Sage, Gambit, Psylocke, Thunderbid, y otros. Inicialmente se forman con el objetivo de buscar los diarios de Destiny, diarios escritos por la mutante donde describe visiones del futuro y que pueden ser muy peligrosos si caen en malas manos.
Entre otras cosas muere Psylocke, regresa el Reverendo Stryker de Dios Ama y el Hombre Mata, y finalmente (supuestamente) crean la primera versión de la XSE (Xavier Security Enforces), el grupo del cual forma parte Bishop en el futuro.

Uncanny X-Men #395-400
Publicación: 2001
Guion: Joe Casey
Arte: Ian Churchill

Chamber (Cámara) se vincula sentimentalmente con una estrella pop y posteriormente pasa a formar parte de los X-Men. Posteriormente se uniría al grupo la prostituta Stacy X y además enfrentarían a una renacida formación de los Purifiers, humanos que matan mutantes en nombre de Dios.

Uncanny X-Men #401 – 406
Publicación: 2002
Guion: Joe Casey
Arte: Aaron Lopresti

Banshee crea su propio grupo de carácter paramilitar formado por miembros como Blob, Avalancha y otros, finalmente no resultan como debían y Mystique termina cortándole la garganta. Otros mutantes diversos como Monet St Croix pasan a formar parte de puntos diversificados en el mundo llamados Corporation X, como filiales de los X-Men.

Uncanny X-Men #425-426
Publicación: 2003
Guion: Chuck Austen
Arte: Philip Tan

Havok esta por casarse con Polaris, la cual ha comenzado a tener problemas de personalidad. En su despedida de soltera baila un tipo vestido como Gambit, y finalmente decide no casarse, desarrollando su nueva personalidad maligna.

Uncanny X-Men #428-434
Publicación: 2003
Guion: Chuck Austen
Arte: Sean Phillips, Philip Tan

Se descubre que Nightcrawler es en realidad hijo de un demonio, perteneciente a una casta llamada los Draco. Entre otras cosas pretenden que Nightcrawler absurdamente ingrese en las esferas altas del pontificado usando su calidad de sacerdote.

Uncanny X-Men #435-436
Publicación: 2004
Guion: Chuck Austen
Arte: Ron Garney

Juggernaut de hace un tiempo ha estado como miembro no oficial de los X-Men, conociendo entre otros a la enfermera Annie, Squid Boy, y otros personajes que aparecieron solo en esta época.
Juggernaut se acuesta con She Hulk, quien luego se sabría no es la She Hulk de esta realidad.

NYX #1-7, Uncanny X-Men #450-451
Publicación: año
Guion: Joe Quesada, Chris Claremont
Arte: Joshua Middleton, Robert Teranishi, Alan Davis

Kidden Nixon, una adolescente inadaptada con poderes de manipular el espacio tiempo, escapa de casa y conoce a una prostituta llamada Laura Kingley. Posteriormente Laura se sabría es una chica que escapó de un proyecto donde la hicieron nacer como clon de Wolverine y eventualmente enfrentaría a los X-Men.

Excalibur (vol 3) #1-4
Publicación: 2004
Guion: Chris Claremont
Arte: Aaron Lopresti

Xavier regresa a Genosha que se encuentra devastada , donde se encuentra con Magneto.
Se sabe que el Magneto que murió en New X-Men en realidad era un impostor.

Astonishing X-Men (vol 3) #1-24, Giant-Size Astonishing X-Men #1
Publicación: 2004-2008
Guion: Joss Whedon
Arte: John Cassaday

Luego de la muerte de Jean Grey, los X-Men de planta que formaban New X-Men, dejarían su status quo solo como profesores y comenzarían nuevamente a abanderar la postura de héroes, simultánea a la escuela. Reingresa Kitty Pryde después de haberse ido, cuando fue a Rusia a esparcir las cenizas de Colossus. Se crean nuevos uniformes. Se encuentra una cura para el gen mutante. Colossus vuelve a la vida con tecnología de Breakworld. Se conoce una rama nueva de SHIELD llamada SWORD, destinada a interactuar con especies inteligentes extraterrestres. Nace Danger, la sala de peligro ahora con cuerpo y vida propia. Cassandra Nova intenta volver a la vida manipulando a todos los de la mansión y aparentemente reviviendo al club fuego infernal. Finalmente viajan a Breakworld a enfrentar a su raza que pretende destruir a la humanidad lanzando una bala gigante, la cual es detenida por Kitty Pryde, quien se pierde en el espacio unida a ella.

House of M #1-8
Publicación: 2005
Guion: Brian Michael Bendis
Arte: Olivier Coipel

En Avengers Dissasembled somos testigos de como Wanda Maximoff comienza a enloquecer. Cuando va a ser detenida por los Avengers es salvada por Magneto, quien la lleva a sus aposentos en Genosha. Temiendo que vengan a capturarla, Wanda, motivada por su hermano Quicksilver, desencadena su poder para cambiar la realidad, creando un mundo donde Magneto es un soberano,la raza mutante es dominante y los humanos son rebeldes.
Wolverine es el único consciente de que las cosas están mal y se une a otros humanos y mutantes para tratar de restaurar todo, lo que provoca un inminente encuentro entre los rebeldes y el gobierno de Magneto. Wanda desesperada restaura la normalidad pero dice su frase “no más mutantes” provocando que la raza mutante se vuelva una raza en extinción y solo sobrevivan con sus poderes no más de 200 mutantes en el mundo.
Wolverine recupera su memoria.